Фамилия Марачков — из числа тех, что не дают однозначного ответа, а скорее предлагают выбрать из нескольких портретов предка. В основе лежит прозвище Марачко, и тут у исследователей расходятся тропы. Первая и самая насыщенная версия отталкивается от глагола «мараковать». Слово это в русских говорах было двуликим: им обозначали и человека, который «мало маракует», то есть туго соображает, и того, кто, напротив, «маракует в деле» — разбирается, умеет, может сноровисто сделать работу. Прозвище Марачко могло закрепиться за кем угодно из этих двоих. Но есть и третий вариант, уводящий к другому глаголу — «марать». Тогда Марачко — это неряха, пачкун или человек, чья работа неизбежно связана с грязью: например, трубочист или печник. В этой версии прозвище давалось не по уму, а по опрятности или роду занятий.

Менее убедительная, но тоже встречающаяся в любительских разборах гипотеза связывает Марачко с белорусским названием марта — «марац». Согласно этой версии, имя Марачко давали младенцу, родившемуся в первый месяц весны, а чередование «ц/ч» объясняют местными диалектными процессами. Однако против этого говорит то, что фамилии от календарных имён вроде Мартов, Мартюков обычно образовывались напрямую, без такого фонетического усложнения. Правдоподобнее выглядит связь именно с глагольным прозвищем — в крестьянской среде, где фамилия Марачков и возникла, внешние черты или поведение становились основой для прозвища куда чаще, чем абстрактное название месяца.

Суффикс -ов указывает на типичную восточнославянскую модель: Марачко → Марачков, то есть «сын Марачка». Фамилия довольно редкая, её географическое ядро, судя по разрозненным данным, тяготеет к западным и южным областям России, где слово «мараковать» было в ходу, а также к востоку Беларуси. Встретить Марачкова можно и в среде потомков однодворцев, и в крестьянских родах — сословной привязки у фамилии нет.