Фамилия Маратин — одна из тех, где за простым звучанием скрывается неочевидная история. На первый взгляд её можно принять за вариант более известной фамилии Маратов, но суффикс -ин указывает на другую модель образования.

В русской антропонимии суффикс -ин обычно присоединялся к основам, оканчивающимся на -а или -я (Петя — Петин, Кузьма — Кузьмин). Основа «Марат» дала бы фамилию Маратов. Маратин же образована от формы «Марата» — либо через женское имя, либо через прозвище в родительном падеже. Чаще всего такие фамилии возникали как ответ на вопрос «чей?»: «сын Мараты» или «человек из дома Мараты».

Само имя Марата — это русская народная форма крестильного имени Марк или Мартын. В некоторых говорах имя Марк произносили как «Мара́к», а уменьшительное «Мара́та» было вполне естественным. То есть предок носителя фамилии мог быть Марком или Мартыном, которого в быту звали Маратой. Вторая версия — прозвище Марата от глагола «марать» (пачкать, чернить). В этом случае фамилия указывала либо на род занятий (например, маляр, трубочист), либо на неопрятного человека. Но прозвищная версия менее вероятна: слово «марать» дало бы скорее фамилии Мараев, Маракин, а форма «Марата» для прозвища редка.

Географически фамилия встречается в центральных и южных областях России, особенно в Воронежской и Ростовской областях, где имя Марк в форме Марат было распространено. В отличие от татарской фамилии Маратов (от арабского имени Марат), Маратин — русская по происхождению, с чисто славянским суффиксом.

Таким образом, Маратин — это «сын Мараты», а Марата — либо уменьшительное от Марка, либо редкое прозвище. Фамилия не массовая, но устойчивая, и её носители в основном — потомки крестьян или мещан из южнорусских губерний.