Фамилия Марганов образована от мужского древнетюркского имени Марган, которое в переводе на русский язык означает «искусный охотник; меткий стрелок, снайпер». У древнетюркских народов имя Марган давалось мальчику с пожеланием, чтобы он стал умелым воином и охотником. Таким образом, потомок человека, которого звали Марган, со временем получил фамилию Марганов.