Фамилия Маркисонов — редкий пример, когда в основе лежит не просто имя, а его «двойная» переработка. Чтобы разобраться в её происхождении, нужно смотреть не столько на корень, сколько на то, как фамилию строили.

В центре — имя Марк (от латинского Marcus, предположительно «посвящённый богу Марсу»). От него образовали уменьшительную форму Маркис (по модели «Иван — Иванис», «Фома — Фомич»). Такие формы с суффиксом -ис в прошлом использовали для обозначения сына или младшего родственника: Маркис — это «маленький Марк» или «сын Марка». А уже от этого прозвища или неканонического имени по самой массовой модели прибавили патронимический суффикс -ов: Маркисонов. Буквально — «потомок того, кого звали Маркис».

Ключевая особенность — редкость суффикса -ис в основе. В русских фамилиях гораздо чаще встречаются Марков, Маркин или Маркелов. Форма Маркисонов говорит о том, что предок носителя жил в среде, где были живы уменьшительно-ласкательные варианты имени, возможно, в северных или центральных областях России, где такие словообразовательные цепочки держались дольше.

Сложно сказать, к какому сословию относился первый Маркисонов. Фамилии на -ов с таким нестандартным корнем встречались и у крестьян (как прозвище, закрепившееся в документах), и у духовенства (семинаристы иногда русифицировали латинские имена по этой схеме). Но то, что в основе не церковная, а бытовая форма имени, склоняет к версии о крестьянском или мещанском происхождении.

Фамилия крайне редкая. В официальных базах и телефонных справочниках она почти не встречается, что делает её надёжным маркером для генеалогического поиска: скорее всего, все носители — потомки одного небольшого рода.