Фамилия Маркушин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Маркушин послужило церковное имя Марк. Фамилия Маркушин восходит к каноническому мужскому имени Марк (римское родовое имя, в переводе с латинского – либо «слабый, вялый», либо «родившийся в марте»). Имя имеет ряд производных форм, одна из которых — Маркуша — и легла в основу данной фамилии. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Маркуша, со временем получил фамилию Маркушин. О точном месте и времени возникновения фамилии Маркушин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Маркушин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.