Фамилия Маркушова образована от мужского имени Маркуш — производной, уменьшительной формы имени Марк. Имя Марк имеет два основных толкования: от латинского marcus — «слабый, вялый», либо связь с месяцем мартом (лат. Martius), то есть «родившийся в марте». Имя Маркуш особенно распространено у поляков и белорусов, что указывает на западные или юго-западные корни рода.

Фамилия построена по стандартной русской модели: основа (Маркуш) + суффикс -ов- (в женском роде — -ова). Такая модель типична для фамилий, возникших в среде крестьян и посадских людей в XVI–XVII веках. Суффикс -уш- в имени Маркуш — ласкательный, характерный для народных форм канонических имён (ср. Петруш, Якуш). Это говорит о том, что предок носителя фамилии был человеком простого сословия, а не знатного рода: полные церковные формы имени (Марк) в ту эпоху чаще оставались у духовенства и дворян.

С евангельской историей имя Марк связано через апостола Марка, спутника Петра и Павла. По преданию, он побывал в Риме, а затем основал христианскую церковь в Александрии. Однако прямая связь с апостолом для носителей фамилии маловероятна: имя давали в честь святого, но фамилия возникла из бытового, а не церковного употребления.

Интересная деталь: фамилия Маркушова — женская форма, но в русской традиции она закрепилась за женщинами, тогда как мужской вариант — Маркушов. В современных базах данных фамилия встречается редко, преимущественно на западе России, в Беларуси и в украинском Полесье. Её однокоренные «родственники» — фамилии Марков, Маркушев, Маркушин, Маркушонок — различаются суффиксами и региональной привязкой: например, -онок типичен для восточной Беларуси, а -ушев — для украинских земель.

Таким образом, фамилия Маркушова — это не просто потомок Марка, а указание на конкретную народную форму имени, бытовавшую в западнорусских и белорусских землях. Предок, скорее всего, не носил полного церковного имени, а в быту звался Маркушем, и по этому прозвищу его дети и внуки получили фамилию.