Фамилия Маругова — женская форма фамилии Маругов. Её основа, скорее всего, восходит к прозвищу или нецерковному имени Маруг. Такие имена на Руси давали не при крещении, а в быту, и они часто отражали внешность, характер или обстоятельства рождения человека.

Самая вероятная версия связывает Маруга с прилагательным «марый», которое в северных и сибирских говорах означало «мутный», «темный», «пасмурный». Маругой могли назвать человека смуглого, с темными волосами или хмурого, нелюдимого. В этом же ряду стоят слова «мара» (туман, мгла, марево) и «марить» (парить, мутить). Так что прозвище могло быть и метеорологическим: Маруг — родившийся в ненастье или в туман.

Менее распространённая гипотеза выводит Маруга из тюркских языков, где корень «мар» мог означать «змея» или «дракон». Однако для славянской среды такое заимствование маловероятно без дополнительных следов в быту или фольклоре. Поэтому версия с «марым» — основная.

Суффикс -ов- указывает на типичную модель русских фамилий: Маругов — сын Маруга. Такие фамилии в основном закреплялись за крестьянами и посадскими людьми, реже — за духовенством. Дворянские роды с такой основой неизвестны, что говорит о простом происхождении носителей.

Географически фамилия Маругов (и Маругова) привязана к северу России: Вологодская, Архангельская области, а также Кировская область и Удмуртия. Это совпадает с ареалом диалектного слова «марый». Встречаемость фамилии невысокая, что делает её характерным локальным признаком — по ней можно предположить, что предки жили в тех краях.

Если отвлечься от прозвищного корня, есть ещё один, совсем редкий вариант: Маруг — искажённое Марк (через уменьшительное Маруша или Маруха). Но тогда фамилия писалась бы скорее как Марухов или Марушин. Так что эта версия — на грани домысла.