Фамилия Марухина образована от прозвища или имени Маруха. Самая вероятная версия связывает её с глаголом «марать»: так могли прозвать неопрятного, пачкотного человека. Менее распространённое объяснение — от просторечной формы имени Мария (Маруха), что в переводе с древнееврейского значит «любимая, желанная; госпожа». В таком случае фамилия указывала бы не на самого носителя, а на его мать или жену по имени Маруха, что характерно для русских фамилий на -ин, образованных от женских имён.

Обратите внимание на суффикс -ин: он типичен для фамилий, которые в основе имеют слово, оканчивающееся на -а или -я. В русской ономастике это одна из самых распространённых моделей, наряду с -ов/-ев. В отличие от фамилий на -ов (от основ на согласный), здесь притяжательное значение более прямое: «чей?» — Марухин, то есть сын или потомок Марухи.

Спор между двумя версиями решается в пользу «марать»: прозвища по внешнему виду или поведению встречаются гораздо чаще, чем фамилии от женских имён в крестьянской среде. Кроме того, форма Маруха как уменьшительное от Мария — скорее южнорусская или украинская черта, тогда как фамилия Марухина фиксируется в разных регионах, включая центральные и северные области. Географически она не привязана к одной местности, что тоже говорит в пользу прозвищного происхождения: неопрятность — универсальный признак, не зависящий от диалекта.