Фамилия Марушкин — это типичный пример русской фамилии, образованной от личного прозвища, а не от церковного имени. Вопрос о её происхождении не закрыт, и у исследователей есть две основные версии, которые стоит разобрать по отдельности.

Первая и самая правдоподобная гипотеза связывает прозвище Марушка с глаголом «марать». В этом случае прозвище носило бытовой, ироничный характер: так могли назвать неопрятного человека, пачкающего одежду или работающего с чем-то грязным. Однако у этой версии есть неожиданный поворот: в языке офеней (бродячих торговцев) словом «марушка» обозначалась гривна, то есть денежная единица. Если опираться на этот факт, то прозвище могло закрепиться за бережливым или богатым купцом, у которого «вода не замутится». Такая трактовка делает фамилию не просто обидным ярлыком, а указанием на социальный статус или характер предка.

Вторая версия выводит фамилию от женского имени Мария. В просторечии и в северных говорах использовалась форма Марушка. Само имя Мария в переводе с древнееврейского означает «любимая, желанная, госпожа». Здесь важно уточнить: фамилии от женских имён образовывались реже, чем от мужских, но они существовали. Их давали либо детям, воспитанным одной матерью, либо в тех семьях, где женщина играла главную роль после смерти мужа. Однако эта версия для фамилии Марушкин выглядит менее убедительной, поскольку прозвищная основа с глаголом «марать» встречается в русской ономастике чаще.

В пользу прозвищного происхождения говорит и ранняя фиксация имени. В труде историка С. Веселовского упоминается Марушка, крестьянин, записанный в Новгороде в 1545 году. Судя по этому факту, имя бытовало в крестьянской среде задолго до того, как фамилии стали массово закрепляться за семьями. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Марушкин означает «сын Марушки» или «человек из семьи Марушки». Такая модель была одной из самых распространённых на Руси, особенно в северных и центральных регионах.

Точное место и время возникновения фамилии Марушкин установить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, с XV по XVII век. Но сам факт, что прозвище попало в новгородские писцовые книги, позволяет предположить, что ядро фамилии сложилось именно в новгородских землях, а уже оттуда распространилось по другим областям. Сегодня фамилия встречается по всей России, но её корни стоит искать на русском Севере.