По одной из них, фамилия восходит к прозвищу, которое образовано от глагола «марать». Скорее всего, Марушкой называли неопрятного человека. Однако такое прозвище мог получить и бережливый или богатый торговец (на языке офеней марушкой называли гривну). Менее вероятно, что эта фамилия образована от женского имени Мария (в переводе с древнееврейского - «любимая, желанная; госпожа»), точнее от его просторечной формы — Марушка. Веселовского записан Марушка, крестьянин, 1545 г., Новгород. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Марушка, со временем получил фамилию Марушкин.