Фамилия Марусин образована от имени Маруся — уменьшительной формы канонического женского имени Мария. В православной традиции это имя переводят как «госпожа», хотя существует и другая версия толкования — «отвергнутая» или «печальная». Фамилия принадлежит к распространённому типу русских фамилий на -ин, который указывает на принадлежность: Марусин буквально значит «чей?» — сын или потомок Маруси.

По суффиксу фамилия однозначно относится к «материнским»: в отличие от патронимических фамилий на -ов/-ев, образованных от мужских имён, -ин часто закреплялся за основой женского имени. Это могло означать, что родоначальником был человек, известный в округе как сын Маруси — вдовы, одинокой матери или просто женщины, которая играла заметную роль в семье. В русских говорах Марусей могли называть не только Марию, но и любую девушку или женщину с ласковым оттенком, поэтому прозвище могло закрепиться и за мужчиной, если его так звали в быту.

Географически фамилия Марусин встречается в разных регионах России, но заметно чаще — в Поволжье и на юге, где имя Маруся было особенно популярно в XIX веке. Встречаются варианты написания с одной «с» — Марусин, и с двойной — Маруссин, но основной и исторически верный — с одной, так как имя Маруся пишется через одно «с».

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, Марусин стоит в одном ряду с Марьиным, Машиным, Манечкиным — все они образованы от производных форм имени Мария. Однако Марусин выделяется тем, что основа не просто уменьшительная, а народно-разговорная, характерная для крестьянской и мещанской среды, где имя Маруся звучало естественнее, чем полное Мария. Это даёт подсказку о социальном происхождении: предки носителей фамилии, скорее всего, не принадлежали к дворянству или духовенству, где предпочитали полные имена и фамилии на -ский.

В дореволюционных метрических книгах фамилия фиксируется с XVIII века, в основном среди государственных крестьян центральных губерний. Встречается и в казачьих областях — на Дону и Кубани, где женские имена в основе фамилии тоже не редкость. Таким образом, фамилия Марусин — это не просто «сын Маруси», а живое свидетельство того, как в русской деревне имя женщины могло стать родовым прозвищем целой семьи.