Фамилия Марянинов — редкий пример того, как простонародная форма церковного имени закрепилась в родовом прозвании. В её основе лежит имя Маряня, которое в старину использовали как уменьшительно-ласкательный вариант сразу двух крестильных имён: Марий и Марин.

Имя Марий пришло из сирийского языка и означает «господин» или «господний». Имя Марин имеет латинские корни и переводится как «морской». Оба варианта встречались в святцах, но в повседневной жизни их часто сокращали до Маряни — так звали и мужчин, и, реже, женщин. Выбор конкретного первоисточника для каждой семьи сегодня установить сложно: в документах XVII–XVIII веков обе линии смешивались.

Словообразовательная модель фамилии необычна для русского ономастикона. Обычно отчество второго порядка строят по цепочке «имя → отчество → фамилия»: Маряня → Марянин (сын Маряни) → Марянинов (внук Маряни). Двойной суффикс —ин + —ов встречается реже, чем одинарный —ов или —ин, поэтому фамилия сохраняет след давней трёхступенчатой системы именования, когда человека могли называть по деду.

В архивных записях фамилия встречается преимущественно в центральных и северных губерниях России, где была сильна традиция бытовых, неканонических форм имён. В переписных книгах XVII века Марянями нередко записывали крестьян и посадских людей — это указывает на демократичное происхождение фамилии, без дворянских корней.

О точной дате и месте возникновения фамилии говорить не приходится: фамилии у крестьянства массово закреплялись лишь в XIX веке, а у более ранних поколений отчества могли писаться по-разному даже в пределах одной семьи. Тем не менее, Маряниновы — живое напоминание о том, как личное имя, пройдя через два поколения, превратилось в устойчивый родовой знак.