Фамилия Марянинов — редкий пример отчества сразу второй степени, то есть «внучества». Если разложить цепочку, получится: Маряня → Марянин (сын Маряни) → Марянинов (внук Маряни). Такая модель встречается нечасто: обычно фамилии закреплялись на первом шаге (Иванов — сын Ивана), а здесь словообразование шагнуло дальше. Суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), а добавленный к нему -ов в финале как раз и создаёт эффект двойного отчества.

Сам корень восходит к имени Маряня — просторечной, уменьшительной форме сразу двух крестильных имён. Первое — Марий (Мар), которое пришло из сирийского языка и значит «господин» или «господний». Второе — Марин, латинское по происхождению, со значением «морской». Обе основы в равной степени возможны: в народной среде церковные имена часто сокращали до неузнаваемости, и разные источники могли сходиться в одной бытовой форме. Правдоподобнее выглядит связь с именем Марин: оно было заметно распространено в старину, а вот редкое имя Марий встречалось реже и вряд ли породило бы устойчивое семейное прозвание.

Интересно, что фамилия сохранила архаичную модель, которая массово исчезла ещё в XVII–XVIII веках, когда отчества второго порядка вытеснялись простыми формами на -ов/-ев. Поэтому Маряниновы — это, скорее всего, потомки человека, жившего в эпоху, когда трёхчленная именная формула только складывалась, а «внучество» было естественным способом отличить одну семью от другой. Сегодня фамилия встречается точечно, в основном в центральной России, и не имеет массового распространения.