Фамилия Машаргина — женская форма, а её основа, мужская фамилия Машаргин, встречается нечасто и при этом неоднозначна по происхождению. Главная трудность в том, что на слух корень «машарг» не похож ни на одно привычное русское слово, а значит, перед нами либо иноязычное заимствование, либо искажённое местное прозвище.

Самый вероятный путь — связь с балтийским или финно-угорским субстратом северо-запада России. В карельских и вепсских говорах есть слово «mašara» — в значении «мешок», «котомка», а также «неповоротливый, увалень». Прозвище Машарга могли дать либо медлительному человеку, либо тому, кто постоянно носил с собой заплечный мешок — бродячему торговцу, нищему, ремесленнику. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Машаргин, то есть сын или потомок Машарги.

Вторая версия, менее убедительная, но имеющая право на существование, — тюркские корни. В языках Поволжья встречается основа «машар» (например, в марийском — «машар» как вариант имени или прозвища). Однако фамилия Машаргин не характерна для татарских или башкирских родов, где обычно используются суффиксы -ов/-ев. Поэтому версия с балтийским или финским субстратом выглядит предпочтительнее.

Географически фамилия тяготеет к северным и северо-западным областям России: единичные носители встречаются в Архангельской, Вологодской областях и в Карелии. Это косвенно подтверждает гипотезу о финно-угорском происхождении: именно там в XIX веке активно шёл процесс русификации местных прозвищ через суффикс -ин.

С точки зрения словообразования фамилия редкая: у неё нет массовых однокоренных «родственников» вроде Машаров или Машарских. Это говорит о том, что прозвище было локальным, возможно, даже принадлежало одной семье в конкретной деревне. Тот, кто носил фамилию Машаргин, скорее всего, был крестьянином или ремесленником из глубинки, а его предок получил прозвище по внешности или занятию, которое не сохранилось в официальных документах.