Фамилия Матухин — редкий пример русской фамилии, в основе которой лежит не отцовское, а материнское прозвище. Её образовали от нарицательного «матуха» — так в некоторых говорах называли мать. Прозвище Матуха, скорее всего, закреплялось за человеком, которого воспитывала одинокая мать, или за самим сыном, выросшим без отца. В крестьянской среде, где родство считали по мужской линии, такое прозвище выделяло семью, и потому оно легко превратилось в фамильное имя.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: суффикс -ин указывает на принадлежность. Если Матуха — это мать, то Матухин буквально означает «сын Матухи». По такому же принципу строились фамилии от личных имён и прозвищ матерей, но их заметно меньше, чем отчеств от отцовских имён. Сравните с фамилиями Матухин и Матухин: в первом случае основа та же, но суффикс -ов, что говорит о возможной разнице в говорах или о разном времени закрепления фамилии.

Точное место и время возникновения фамилии Матухин назвать сложно: фамилии на Руси складывались веками, и процесс этот шёл неравномерно — где-то раньше, где-то позже. Однако сам факт, что за основу взяли прозвище матери, делает фамилию любопытным памятником народной речи и семейного уклада. В ней сохранилось диалектное слово, которое в современном языке почти исчезло, а вместе с ним — и память о той женщине, чьё имя или роль в семье стали началом целого рода.