Фамилия Матякубов происходит от составного мужского имени Матякуб, которое чаще всего встречалось в Узбекистане и соседних регионах Средней Азии. Имя сложили из двух основ, и каждая из них несла свой смысл. Первая часть — «мат» — это краткая форма имени Мухаммед. В переводе с арабского оно означает «восхваляемый, прославляемый». У этого имени много производных и диалектных вариантов: Мухамет, Махмут, Ахмет, Хаммат, Хамит, Мухамай, Мухамми, Мухам, Мукамай, Мукай, Мукач, Мухач, Мамай, Мамак, Мамук, Мамаш, Мамет, Мамбет, Мамыш, Матджан, Матдан. Вторая часть восходит к имени Якуб — арабскому варианту древнееврейского Иаков, того самого, что в русской традиции стал Яковом. Значение у него — «сопутствующий, сопровождающий, идущий следом, не отстающий».

Складывая эти смыслы, родители, нарекая сына Матякубом, желали ему стать достойным мусульманином — прославляющим Бога и не сбивающимся с верного пути. Суффикс «-ов» в фамилии — типичный русский патронимический показатель, который закрепился при оформлении фамилий в документах, поэтому буквально Матякубов означает «сын Матякуба». Интересно, что в самом Узбекистане такая фамилия могла бы писаться иначе, но в русскоязычной среде прижился именно этот вариант. Стоит отметить, что имя Мухаммед в народной среде давало десятки сокращённых форм, и «мат» — одна из самых коротких и неочевидных для постороннего глаза. Поэтому человек с фамилией Матякубов, даже не зная истории, носит в ней память о двух древних именах — арабском и древнееврейском, которые встретились в одном имени благодаря исламской традиции.