Фамилия Матякубов ведет свое начало от мужского имени Матякуб, преимущественно распространенного на территории Узбекистана. Это имя образовалось путем сложения двух основ. Первая из них - «мат» - является краткой формой мусульманского мужского имени Мухаммед. В переводе с арабского языка это имя означает «восхваляемый, прославляемый». Это имя имеет множество производных и диалектных форм: Мухамет, Мухаммед, Махмут, Ахмет, Хаммат, Хамит, Мухамай, Мухамми, Мухам, Мукамай, Мукай, Мукач, Мухач, Мамай, Мамак, Мамук, Мамаш, Мамет, Мамбет, Мамаш, Мамыш, Матджан, Матдан. Вторая часть имени Матякуб восходит к имени Якуб, которое является арабским вариантом древнееврейского имени Иаков (русское Яков) и имеет значение «сопутствующий, сопровождающий, не отстающий, идущий следом». Вероятно, родители, нарекая ребёнка именем Матякуб, желали своему сыну стать достойным мусульманином.