Фамилия Мавлиханов — одна из тех, где на стыке двух культурных традиций рождается имя, а затем и фамилия. Её основа — составное мужское имя Мавлихан, которое соединило арабское и тюркское начала. Первая часть, «Мавли», восходит к арабскому слову со значением «господин» или даже «Аллах». Вторая часть — древнетюркское «хан», то есть «повелитель, властелин». Имя Хан в прошлом давали мальчикам, желая им могущества и богатства, словно наследникам ханского престола.

Собирая эти две основы, родители, называя сына Мавлиханом, вкладывали в имя двойное пожелание: чтобы он был достойным мусульманином и чтобы в жизни достиг положения, близкого к господскому. Фамилия образовалась по русской модели: к восточному имени добавили типичный русский суффикс -ов, превратив имя в фамилию, отвечающую на вопрос «чей?» — «сын Мавлихана». Такая модель — одна из самых распространённых в России для фамилий нерусского происхождения.

На письме фамилия встречается и в варианте Мавлиханов, и, реже, как Мавлиханов. Разница в ударении или написании может указывать на региональные особенности или на то, как имя записали при первой фиксации в документах. В любом случае, носитель такой фамилии — потомок человека, чьё имя было не просто набором звуков, а целой программой на жизнь: соединить божественное покровительство с земной властью.