Фамилия Мавлиханова образована от мужского имени Мавлихан, которое, как и многие восточные имена, восходит к двум основам. Первая из них — арабское имя Мавли, означающее «господин; Аллах». Вторая часть — древнетюркское имя Хан, которое переводится на русский язык как «повелитель, властелин». Имя Хан давалось ребенку (мальчику) с пожеланием ханской власти и богатства. Вероятно, родители, нарекая ребёнка именем Мавлихан, желали своему сыну стать достойным мусульманином. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Мавлихановых можно лишь на основании генеалогических исследований.