Фамилия Майдукова — женская форма фамилии Майдуков, и её разбор стоит начать с мужского варианта, так как он хранит ключ к происхождению. Основа фамилии — слово «майдук» или «майду́к», которое в русских говорах, особенно в южных и поволжских регионах, имело несколько значений. Чаще всего «майдуком» называли ленивого, медлительного человека, увальня. Слово это тюркского происхождения, восходит к корням со значением «вялый», «слабый», и попало в русские диалекты через контакты с татарским или башкирским населением. Таким образом, Майдуков — это прозвищная фамилия: предок мог получить прозвище Майдук за свой неторопливый нрав или даже в шутку, по контрасту с характером.

Суффикс -ов- указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ и личных имён, закрепившуюся в XVI–XVII веках. Форма Майдукова, соответственно, означает «жена или дочь Майдукова». Географически фамилия тяготеет к районам бывшего расселения тюркских народов: её можно встретить в Татарстане, Башкирии, Оренбургской и Самарской областях. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном происхождении — скорее всего, от конкретного прозвища в одной или нескольких соседних деревнях.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: связь с тюркским именем Майдук, которое могло быть уменьшительной формой от имени Майдан (в значении «площадь», «место сбора») или от арабского Маймун («счастливый»). Однако прозвищная основа надёжнее, так как в русской ономастике фамилии от диалектных прозвищ с отрицательной или нейтральной характеристикой встречаются гораздо чаще, чем от редких личных имён.

Примечательно, что фамилия Майдуков не имеет отношения к майскому празднику или к маю как месяцу — это типичная ошибка при поверхностном взгляде. Слово «май» в данном случае — лишь часть тюркского корня, который в русском языке оброс суффиксами и утратил исходную семантику. Так что предки современных Майдуковых, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими своё родовое имя от характерного прозвища, записанного в переписных книгах XVII–XVIII веков.