Фамилия Мендиякова образована по самой распространённой в русском языке модели — с суффиксом -ов/-ев, который в женском роде принимает форму -а. Мужской вариант — Мендияков. Такая модель в XVI–XIX веках закрепилась за большинством русских фамилий, особенно за теми, что возникли в крестьянской и мещанской среде. Однако основа здесь не славянская, а тюркская, что сразу указывает на географию происхождения: скорее всего, предки носителя фамилии жили в зоне контакта русских и тюркских народов — в Поволжье, на Урале или в Западной Сибири.

Корень фамилии — Мендияк. Это личное имя или прозвище, которое восходит к тюркскому слову «менди» (или «менде») — «родинка», «родимое пятно». В башкирском, татарском, казахском языках такие имена давали детям с приметной родинкой: считалось, что это знак счастливой судьбы. Суффикс -як в тюркских именах часто выполнял уменьшительно-ласкательную или принадлежностную роль, так что Мендияк буквально означает «тот, у кого родинка» или «родиночка». Имя известно в антропонимиконе башкир и татар, встречается в документах XVIII–XIX веков среди тептярей и ясачных крестьян.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с арабским именем Менди (Махди) — «ведомый по правильному пути». Но в этом случае форма Мендияк выглядит как народная переделка, а не как прямое заимствование. Первый вариант — с родинкой — надёжнее, поскольку он типичен для тюркской традиции имён-оберегов и прозвищ по внешности.

По суффиксу -ов фамилия обрусела: когда тюркское имя Мендияк попало в русскую среду, к нему добавили стандартное русское окончание, чтобы обозначить принадлежность роду. То есть Мендияковы — это «дети (или потомки) Мендияка». Фамилия недворянская: у знатных родов чаще встречались суффиксы -ский или -ич, а -ов — маркер крестьянского, казачьего или посадского происхождения. Встречается она в основном в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской и Челябинской областях, что подтверждает её региональные корни.

Однокоренные фамилии — Мендеев, Мендияров, Мендибаев. Они построены по той же схеме, но с разными тюркскими формантами. Мендиякова выделяется именно суффиксом -як, который реже встречается в русских фамилиях и делает её заметной на фоне более частых вариантов.