Фамилия Меньжуков — одна из тех, где корень угадывается не сразу. На слух она напоминает то ли «меньшой», то ли «менжуй», но на деле всё прозрачнее: в основе лежит древнерусское прозвище Меньжук, а то, в свою очередь, образовано от прилагательного «меньшой» — то есть младший. В крестьянской и купеческой среде так называли младшего сына, младшего брата или просто человека невысокого роста. Суффикс -ук (-юк) типичен для южнорусских, украинских и белорусских говоров: он превращал нарицательное слово в личное прозвище (ср. Казак — Казанюк, Малый — Малюк). Меньжук — буквально «младшенький», «меньшой».

Фамилия образована по стандартной восточнославянской модели на -ов: Меньжук + -ов = «сын Меньжука» или «из рода Меньжуковых». Такие фамилии закреплялись в основном в XVI–XVII веках, когда прозвища переходили в наследственные. Интересно, что в некоторых говорах «меньжук» могло означать не просто младшего, а работника, подмастерья или младшего по положению — социальный оттенок, который со временем стёрся.

Географически фамилия Меньжуков тяготеет к югу России — чаще всего встречается в Воронежской, Ростовской областях и в Краснодарском крае. Это косвенно подтверждает версию о южнорусском происхождении суффикса. В центральных и северных регионах России та же основа дала бы фамилию Меньшиков (от Меньшик) или Меньшаков (от Меньшак). Меньжуков остался более локальным вариантом.

Встречается и альтернативная версия: от тюркского слова «менжук» — «жемчуг» (ср. монжук, манжук). Но она маловероятна: во-первых, фамилия с таким корнем не зафиксирована в регионах активных тюрко-славянских контактов, во-вторых, славянская этимология покрывает все словообразовательные звенья без натяжек. Так что предки современных Меньжуковых — скорее всего, крестьяне или посадские люди, в роду которых был «меньшой» сын или невысокий человек, получивший соответствующее прозвище.