Фамилия Мерекина образована от прозвища Мерека, которое восходит к диалектному слову «мерекать», то есть «бредить, смекать». Вероятно, такое прозвище указывало на черты характера и поведение его обладателя. Так могли называть сообразительного человека, способного быстро оценить ситуацию и предпринять наиболее правильный порядок дальнейших действий. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мерека, со временем получил фамилию Мерекина.