Фамилия Мереков — редкий случай, где географический ключ важнее морфологического. Она почти наверняка происходит не от прозвища или имени, а от названия населённого пункта. Основа «Мерек» встречается в топонимике: есть село Мерек в Казахстане (в прошлом — на землях Семиреченского казачьего войска), а также несколько урочищ и речек с похожим именем в Сибири и на Алтае. Выходец из такого места получал прозвание «Мерек», а его потомки — фамилию Мерековы.

Суффикс -ов указывает на стандартную русскую модель образования от географического названия или отчества, но сам корень явно не славянский. Скорее всего, он тюркского происхождения. В тюркских языках «мерек» может означать «цель», «мишень», а в переносном смысле — «меткий стрелок». Вторая версия связывает слово с диалектным «мерек» — «мерка», «мера», но она менее убедительна: прозвище Мерек в значении «человек, который всё отмеряет» или «скупой» маловероятно для основы фамилии.

Основной ареал фамилии сегодня — юг Западной Сибири и север Казахстана, что совпадает с историческими местами расселения сибирских казаков и переселенцев. Мерековы могли быть потомками крестьян-переселенцев или казаков, записанных по месту жительства. Дворянских родов с такой фамилией в дореволюционных родословных книгах не зафиксировано — это крестьянская или казачья фамилия. Встречается она нечасто: по данным открытых источников, в России насчитывается не более нескольких сотен носителей, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска.