Фамилия Меркухин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Меркухин послужило церковное имя Меркурий. Имя Меркуха восходит к имени древнеримского бога, покровителя торговли — Меркурия, который изображался с крылышками на ногах. Один из Меркуриев пострадал в III веке за христианскую веру и был объявлен церковью великомучеником. В честь него Меркурием был наречен монах, ставший в XIII веке смоленским епископом, а уж в память последнего тысячи простых русских крестьянских ребят были крещены Меркуриями. В просторечии их называли Меркухами, иногда же называли Меркушами. Таким образом, в основе фамилии Меркухин лежит просторечная форма крестильного имени Меркурий. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Меркуха, со временем получил фамилию Меркухин. О точном месте и времени возникновения фамилии Меркухин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Меркухин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.