Фамилия Меркуриев — редкий случай, когда церковное имя перешло в фамилию почти без изменений, сохранив свою латинскую основу. В основе лежит каноническое имя Меркурий, которое в святцах носил раннехристианский мученик III века. Само имя происходит от латинского Mercurius — так римляне называли бога торговли, покровителя путешественников и воров. В русскую традицию имя попало через Византию вместе с христианством, но широкого распространения в народе не получило: слишком книжным и «учёным» оно звучало для крестьянской среды.

Фамилия образована по стандартной модели «имя + суффикс -ев», который присоединяли к основам на мягкий согласный или -й. Меркуриев буквально означает «сын Меркурия» или «принадлежащий Меркурию». Интересно, что в русских говорах имя часто искажали: в документах XVII века встречаются формы Меркул, Меркуша, Меркушка. От этих обиходных вариантов пошли более привычные фамилии Меркулов, Меркушев, Меркушкин. Меркуриев же — это «высокий» вариант, который могли носить либо выходцы из духовного сословия, где ценили полную форму имени, либо грамотные люди, старавшиеся писать фамилию «по-церковному».

Поскольку имя Меркурий не было массовым, фамилия Меркуриев встречается редко. В дореволюционных справочниках её носители — это в основном священники и псаломщики, реже — мещане в городах центральной России. Светская аристократия такую фамилию не носила: она слишком явно указывала на происхождение от крещёного предка, а не на землевладение или службу.

С точки зрения словообразования фамилия примечательна тем, что сохранила полную основу имени без усечения. В русской ономастике это нетипично: обычно имена сокращали (Иван — Иванов, Пётр — Петров). Меркуриев — пример того, как книжная, письменная традиция победила устную, и фамилия закрепилась в той форме, в которой была записана в метрике, а не в той, что звучала в быту.