Фамилия Меркурисов — редкий случай, когда в основе лежит не имя, а прямое заимствование из античной мифологии. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, произведённых от крестильных имён (Иванов, Петров) или прозвищ, Меркурисов напрямую восходит к имени римского бога торговли, покровителя путешественников и воров — Меркурия.

Такая модель образования нехарактерна для крестьянской и мещанской среды. В русской ономастике фамилии, образованные от имён античных божеств, как правило, указывают на духовное сословие. Семинаристы при поступлении в училище нередко получали «искусственные» фамилии — звучные, книжные, часто латинизированные. Меркурисов мог появиться из греческой формы имени Гермес или напрямую из латинского Mercurius, но суффикс -ов выдаёт именно русскую адаптацию: от основы Меркурис (церковнославянская форма имени Меркурий) добавили типичный патронимический суффикс.

Вторая, менее вероятная, версия — фамилия могла возникнуть от прозвища Меркурий, данного мирянину. В старину так могли назвать бойкого, подвижного человека, «верткого, как ртуть» (само слово «меркурий» в старорусском языке означало ртуть, и это тоже могло стать основой для прозвища). Но в таком случае мы ожидали бы фамилию Меркурьев или Меркулов — они встречаются чаще. Форма Меркурисов с ударением на втором слоге (МеркУрисов) сохраняет книжное, латинское произношение и явно отсылает к семинарской традиции.

Интересно, что в Российской империи фамилия Меркурисов была крайне редкой и фиксировалась преимущественно в центральных губерниях, где располагались духовные училища. Поскольку фамилия искусственная, у неё нет географического «гнезда» в одном уезде — её носители могли появиться в любой епархии, где ректор семинарии любил давать воспитанникам «мифологические» фамилии. Сегодня Меркурисовы встречаются единично, и фамилия остаётся одной из тех, что по одной только форме выдают происхождение предка из среды сельского духовенства.