Фамилия Мигуськин образована от прозвища Мигуська, и в основе её лежит глагол «мигать», то есть «моргать». Казалось бы, всё просто, но за этим внешне прозрачным корнем скрывается интересная развилка: в тверских говорах существовал диалектный глагол «мигалить» — «хлопать глазами, зевать». Если прозвище пошло от него, то Мигуськой могли называть человека рассеянного, вечно смотрящего по сторонам, словно бы невпопад моргающего. Вторая версия менее вероятна, но и её нельзя сбрасывать со счетов: в некоторых регионах «мигуном» или «мигаем» дразнили тех, кто часто и выразительно моргал, — возможно, из-за привычки или глазного недуга.

Само прозвище Мигуська звучит ласкательно-уменьшительно, с суффиксом -уськ-, который придаёт именованию оттенок простонародной фамильярности. Такие формы были типичны для деревенской среды: от них без особых ухищрений образовывались фамилии на -ин. Так и Мигуська, закрепившись за конкретным человеком как его постоянное обиходное имя, со временем дало жизнь фамилии Мигуськин — то есть «сын Мигуськи», потомок того самого обладателя прозвища.

Интересно, что фамилия эта встречается не повсеместно, а тяготеет к северо-западным и центральным русским областям, что косвенно подтверждает связь именно с тверским диалектным словом. В письменных источниках XVII–XVIII веков подобные прозвища фиксировались в писцовых книгах, но конкретных упоминаний именно Мигуськиных в них не сохранилось — фамилия осталась в тени более массовых образований. Зато родственные ей фамилии — Мигунов, Мигалкин, Мигулин — встречаются чаще, и все они восходят к тому же корню, что лишний раз подтверждает: прозвища, связанные с морганием, были в ходу у наших предков.