Фамилия Мигуцкий происходит от личного прозвища Мигута, которое, в свою очередь, восходит к глаголу «мигать», то есть «моргать». Такая модель образования — от прозвища через отчество к фамилии — одна из самых распространённых в русской ономастике. Суффикс -цкий указывает на возможное географическое или сословное происхождение, но в данном случае он скорее выполняет функцию облагораживания простого прозвища, придавая ему форму, характерную для польских или западнорусских фамилий.

Однако есть и другая версия, более интересная. В тверских говорах существовал диалектный глагол «мигалить», означавший «хлопать глазами, зевать». Если принять эту гипотезу, то Мигутой могли называть человека рассеянного, невнимательного, вечно смотрящего по сторонам. Эта версия правдоподобнее: она объясняет не только основу, но и сам суффикс -ут-, который часто использовался в прозвищах для характеристики человека по его поведению (ср. зевута, ревута). В таком случае фамилия изначально несла не нейтральное, а ироничное значение, закрепляя за предком репутацию мечтателя или ротозея.

Позже прозвище Мигута, изначально присоединённое к наследственному имени, полностью заменило его как в повседневной жизни, так и в официальных документах. Это типичная история: в XV–XVII веках прозвища нередко вытесняли крестильные имена, особенно в среде крестьян и посадских людей, где внутрисемейные и уличные имена были в ходу больше, чем церковные. К XVIII веку, когда фамилии начали закрепляться окончательно, форма Мигуцкий уже звучала как полноценное родовое имя.

Стоит обратить внимание и на то, что фамилия не получила распространения по всей России, а встречается преимущественно в регионах, исторически связанных с западнорусскими землями и Польшей. Это косвенно подтверждает версию о диалектной основе: тверской говор — как раз переходная зона между северным и южным наречиями, и слово «мигалить» могло быть занесено туда с запада. Впрочем, не исключено, что часть носителей фамилии имеет польские корни, где суффикс -цкий встречается гораздо чаще, чем в великорусских землях. Точных данных о сословной принадлежности первых Мигуцких нет, но по модели образования можно предположить, что это были крестьяне или однодворцы, получившие фамилию не по имени отца, а по уличному прозвищу.