Фамилия Миканёв — редкий случай, где ударение на последнем слоге неслучайно и указывает на способ образования. В отличие от большинства русских фамилий на -ов, где ударение падает на основу (Иванов, Кузнецов), здесь оно фиксированное, на суффикс. Это верный признак того, что фамилия образована от прозвища или имени, оканчивающегося на -аня, -уня или -ыня: Миканя, Микуня, Микыня. Суффикс -ёв (а не -ев) появляется именно после мягких или шипящих согласных в основе, и в фамилии Миканёв он закономерен: основа Микан- плюс -ёв.

Корень — Мик-. Это сокращение от полного имени Михаил, распространённое в диалектах и просторечии. Михаил — имя древнееврейского происхождения, означающее «кто как Бог». В русской традиции оно дало множество уменьшительных форм: Миша, Мика, Миканя, Микуня. Прозвище Миканя или Микан могло закрепиться за человеком как в бытовом общении, так и в документах, а затем перейти в фамилию сына: «чей? — Миканёв», то есть сын Микани.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России, где была распространена форма Миканя вместо более южного Миша. Встречается она в Архангельской, Вологодской, Кировской областях, а также в Пермском крае. Это зона бытования «окающих» говоров, где редукция гласных слабее, и форма Миканя сохраняла чёткое звучание.

В ономастическом словаре Б. Унбегауна модель фамилий на -ёв от прозвищ на -аня описана как продуктивная для севернорусских территорий. Миканёв стоит в одном ряду с фамилиями Ванёв (от Ваня), Санёв (от Саня), Петрунёв (от Петруня). Все они образованы по одному принципу: основа на -аня/-уня плюс суффикс -ёв. Никакой альтернативной этимологии — от тюркских или финно-угорских корней — для этой фамилии не предлагается, и она не нужна: славянская модель прозрачна.

Владельцы фамилии Миканёв происходят из крестьянской или мещанской среды — фамилия недворянская, без суффикса -ский, что говорит о её позднем оформлении, в основном после отмены крепостного права, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам отцов. Предок носителя фамилии, скорее всего, был человеком по имени Миканя — либо по домашнему обиходу, либо по прозвищу, которое закрепилось в переписи.