Фамилия Миключев — редкая и морфологически прозрачная, но с неочевидной основой. Она образована по типичной модели с суффиксом -ев, который в русских фамилиях присоединялся к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или на -й. Значит, в основе лежало личное имя или прозвище Миключ.

Самая вероятная версия: Миключ — это вариант канонического имени Никифор (в просторечии Микифор, Микифора). В северных и центральных русских говорах имя могли переделывать до неузнаваемости: Никифор → Микифор → Микфор → Миклюй → Миключ. Суффикс -юч (как в именах Ильюч, Петрюч) характерен для уменьшительно-ласкательных форм. Таким образом, Миключев — потомок человека, которого в быту звали Миключ, то есть «маленький Никифор».

Вторая версия, менее убедительная, связывает фамилию с диалектным словом «миклюк» — так в некоторых областях называли неуклюжего, мешковатого человека. Прозвище Миключ могло закрепиться за медлительным или неловким крестьянином, а потом перейти в фамилию. Однако у слова «миклюк» нет устойчивого «ч» в суффиксе, поэтому версия с именем выглядит предпочтительнее.

Фамилия Миключев — редкая. Она почти не встречается в крупных исторических переписях и современных телефонных справочниках за пределами отдельных районов. Скорее всего, её носители — потомки крестьян или посадских людей из северных губерний (Вологодская, Архангельская, Вятская), где имя Никифор было особенно популярно и где охотно образовывали краткие формы на -юч. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — в «Общем гербовнике» её нет.

Однокоренные фамилии — Миклюков, Миклюшин, Миклушев — все они восходят к тому же имени Никифор, но через разные суффиксы. Миключев стоит в этом ряду особняком из-за редкого окончания -юч: оно указывает не на отца (как -ов/-ев), а скорее на прозвище самого первого носителя. То есть фамилия могла закрепиться не по отцу, а по деду или даже по уличному прозвищу, которое потом стало наследственным.