Фамилия Миклюкова — женская форма от Миклюков, и её разбор стоит начать с мужского варианта. Основа фамилии — прозвище Миклюк, которое образовано с помощью суффикса -юк, типичного для украинской, белорусской и южнорусской ономастики. Этот суффикс часто указывает на уменьшительность или принадлежность к чему-либо, но в фамилиях он закрепился как указатель на человека по его характерному признаку, занятию или имени.

Корень «Микл-» неочевиден и допускает несколько трактовок. Самая вероятная версия — связь с именем Михаил через народные формы вроде Микла, Микля. В южных и западных говорах имя Михаил могли сокращать до Миклы, а суффикс -юк превращал это в «сын Миклы» или «человек, относящийся к Микле». То есть Миклюк — потомок или свойственник некоего Миклы, а Миклюкова — его дочь или жена.

Менее распространённая, но возможная версия — происхождение от слова «микло», которое в некоторых диалектах означало «мямля» или «неповоротливый человек». Тогда Миклюк — прозвище по характеру, а фамилия Миклюкова прямо указывает на то, что родоначальник носителей фамилии был медлительным или нерасторопным. Однако эта гипотеза слабее, потому что диалектное «микло» встречается редко и не имеет широкой фиксации в ономастических словарях.

С точки зрения географии, фамилия Миклюков (и Миклюкова) тяготеет к западнорусским и украинским регионам — Брянской, Смоленской областям, а также к востоку Украины. Это объясняется ареалом распространения суффикса -юк, который в чисто русских фамилиях встречается реже, чем на юге.

Сословно носители фамилии Миклюковы, скорее всего, были крестьянами или мещанами. Дворянских родов с такой фамилией в дореволюционных родословных книгах не зафиксировано, что подтверждает её народное, прозвищное происхождение. Фамилия не перегружена историческими событиями, но сохраняет живую связь с личным именем или бытовой характеристикой предка.