Фамилия Микрин в своей основе почти наверняка имеет личное прозвище Микрый. В калужско-мещерских говорах это слово означало «малый, маленький», так что прозвище могло закрепиться за невысоким человеком или за младшим в семье. Однако существует и вторая, не менее интересная версия происхождения, которую стоит рассмотреть.

Согласно альтернативной гипотезе, в основе фамилии лежит прозвище Микря, родственное старинному слову «микрюк» — так в некоторых говорах называли бирюка, то есть волка. В переносном смысле бирюком звали человека нелюдимого, замкнутого, предпочитающего уединение, либо того, кто селился отдельно, на отшибе, в глухом месте. Если следовать этой версии, то прозвище Микря или Микрый отражало характер или образ жизни предка, а не его внешность.

Обе версии имеют право на существование, и обе опираются на реальные диалектные слова. Какая из них верна для конкретной семьи Микриных — сказать сложно, но словообразовательная модель в обоих случаях типична для русских фамилий: к основе прозвища на -ый или -я добавился стандартный суффикс принадлежности -ин, указывающий на «сына такого-то». То есть Микрин буквально означает «сын Микрыя» или «сын Микри».

Интересно, что фамилия с таким корнем встречается не только в калужско-мещерском регионе, но и в других областях, где бытовали похожие диалектные слова. В любом случае, прозвище закрепилось за человеком как основное именование и со временем, перейдя к потомкам, превратилось в фамилию. Потомок того самого Микрыя — малорослого или, наоборот, нелюдимого и сурового — и стал первым Микриным.