Фамилия Микрякова образована от мужского имени или прозвища Микряк. Основа здесь — разговорная форма крестильного имени Никифор (в переводе с греческого — «несущий победу»). В русских говорах имя Никифор переделывали в Микифор, Микря, Микряк — так отсекали часть основы и добавляли экспрессивный суффикс -як. Такая модель типична для северных и поволжских регионов, где фамилии на -яков нередко фиксировали именно прозвищные, а не полные церковные формы имени.

Притяжательный суффикс -ов указывает на прямую связь: Микряков — «сын Микряка». Первые носители фамилии, скорее всего, жили на территории бывшего Нижегородского края или в Марийском Поволжье. В этих местах имя Микряк встречается в документах XVII–XVIII веков, и фамилия Микряков закрепилась в среде крестьян и посадских людей.

Есть и другая, менее вероятная версия: от тюркского слова «микряк» — «жадный, скупой». Но она плохо согласуется с русской словообразовательной моделью. Прозвище Микряк в русской среде почти всегда восходит к имени Никифор, а не к заимствованному корню с негативным значением.

Встречается фамилия в двух написаниях: Микряков и Микрякова (женская форма). Ударение падает на второй слог — Микря́ков. Встречаемость невысокая, фамилия редкая, что подтверждает её локальное происхождение из конкретного региона, а не массовое распространение через дворянские или купеческие роды.