Фамилия Миндукшева — редкий случай, когда в основе лежит не славянское имя или прозвище, а тюркское мужское имя Миндук. Встречается она преимущественно у народов Северного Кавказа, особенно у балкарцев и карачаевцев, а также у ногайцев. Фамилия образована по русской словообразовательной модели с суффиксом -ев, который присоединили к тюркской основе, чтобы адаптировать её в русской паспортной системе. Мужской вариант — Миндукшев.

Имя Миндук (или Миндюк) восходит к тюркскому корню «мин» — «тысяча» (иногда в значении «множество, великое множество») и аффиксу -дук, который может указывать на обладание качеством. Буквально Миндук можно перевести как «обладающий тысячью» или «имеющий тысячу» — в переносном смысле это могло означать «богатый», «могущественный», «предводитель тысячи воинов». В кочевой среде такой титул или прозвище давали человеку, который командовал крупным отрядом или владел большим количеством скота.

Интересна и фонетическая особенность: в некоторых диалектах имя звучит как Миндюк, а фамилия — Миндюков. Однако вариант через «ш» (Миндукшев) характерен для карачаево-балкарского произношения, где звук «к» перед гласным смягчается и переходит в «ш». Таким образом, Миндукшев — это не что иное, как «сын Миндука», где «Миндук» — это не имя вообще, а прозвище, данное предку за его статус или богатство.

С точки зрения социального происхождения, носители фамилии Миндукшева, скорее всего, принадлежали к узденям (свободным общинникам) или даже к старшинам. Фамилия не княжеская и не рабская, а указывает на зажиточного и уважаемого человека, который мог выставить или возглавить тысячу всадников. Встречается она нечасто, поэтому её носители, как правило, могут проследить родство в пределах нескольких аулов в Кабардино-Балкарии или Карачаево-Черкесии.