Фамилия Мисинева — женская форма, а её мужской вариант — Мисинев. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Мисинь. Слово «мисинь» в русских говорах имело несколько значений, и чтобы понять, какое из них дало фамилию, нужно смотреть на регион её бытования. В архангельских и вологодских говорах «мисинями» называли плаксу, нюню, человека, который постоянно хнычет. В других областях «мисень» или «мисинь» — это уменьшительно-ласкательное обращение к ребенку, от слова «милый» (ср. «мисенька»). Третья версия отсылает к диалектному глаголу «мисить» — месить, мять, пачкать. Тогда Мисиней могли прозвать неопрятного человека или того, кто работал с глиной, тестом.

Суффикс -ев указывает на патронимическое происхождение: Мисинев — буквально «сын Мисиня». Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ или уменьшительных форм крестильных имён. Сравните: Мисюрев, Мисников — однокоренные фамилии, но с разными суффиксами, что говорит о разных диалектных вариантах одного корня.

Интересно, что фамилия Мисинева (и Мисинев) не встречается в центральных губерниях России, а сосредоточена на севере и северо-востоке — в Вологодской, Архангельской, Кировской областях. Это подтверждает версию о севернорусском диалектном происхождении. Встречается она и в Белоруссии, где «місінь» могло означать «милый» или «ласковый».

Таким образом, предок носительницы этой фамилии, скорее всего, был человеком из северной деревни, которого в округе звали за характер Мисинем — либо за излишнюю плаксивость (если прозвище было насмешливым), либо, наоборот, за мягкость и доброту. Второй вариант — прозвище, данное по роду занятий, связанному с замешиванием чего-либо. Уверенно выбрать одну версию можно только по конкретной семейной истории.