Фамилия Мизенюк — украинская по происхождению, что сразу видно по суффиксу -юк. В ономастике этот суффикс считается типичным для западных и центральных областей Украины (Волынь, Подолье, Галичина). Он указывает на «малого» или «потомка»: Мизенюк — буквально «сын Мизена» или «маленький Мизен».

Основа фамилии — прозвище Мизен или Мизень. Точное значение установить непросто, но есть две основные версии. Первая, самая вероятная, — от украинского диалектного слова «мизний», то есть слабый, хилый, малорослый. В таком случае прозвище давали человеку невысокого роста или некрепкого здоровья. Вторая версия — отчество от уменьшительной формы имени Михаил (в народной речи — Мизько, Мизеня). В русских говорах и украинском языке имя Михаил давало множество производных: Мизя, Мизик, Мизун, так что Мизен могло быть просто домашним именем.

Интересная деталь: фамилия Мизенюк встречается почти исключительно в трёх регионах — на западе Украины (Ровенская, Хмельницкая области) и в соседней юго-западной Беларуси (Брестчина). Это типичный ареал для фамилий на -юк, которые массово закрепились в XVI–XVII веках, когда польская шляхта требовала от крестьян «оседлости» и фиксированных фамилий. Предки Мизенюков, скорее всего, были свободными крестьянами или мещанами, а не шляхтой: фамилии на -юк редко встречались у знати.

В написании фамилии возможны варианты — Мизенюк, Мизенюк (через «и»), а в польских метриках иногда писали Mizenik. Но современная норма закрепилась именно с «юк» и ударением на последний слог. Фамилия редкая: по открытым данным, в России её носят буквально несколько десятков человек, и почти все они — потомки переселенцев с Западной Украины времён Столыпинской реформы или послевоенных перемещений.