Фамилия Моиссенко — яркий пример украинской модели образования фамилий с суффиксом -енко. Этот суффикс, один из самых распространённых в украинской ономастике, изначально имел значение «сын» или «маленький», «потомок». Таким образом, Моиссенко буквально означает «сын Моисея». Основа фамилии — каноническое библейское имя Моисей (в украинском произношении — Мойсей, отсюда украинская фамилия Мойсеєнко). Русское написание «Моиссенко» — это результат адаптации украинской фамилии к русской орфографии, при которой двойное «с» передаёт долготу звука, возникшую на стыке корня и суффикса.

Имя Моисей пришло на Русь вместе с христианством. В библейской традиции Моисей — пророк и законодатель, выведший еврейский народ из Египта. Однако в народной среде имя не было таким же популярным, как, скажем, Иван или Пётр. Чаще его давали при постриге в монахи или в семьях, где чтили Ветхий Завет. Поэтому фамилия Моиссенко, скорее всего, возникла в среде крестьян или казаков, где имя Моисей, пусть и не часто, но использовалось. Суффикс -енко окончательно закрепился на Левобережной Украине (Черниговщина, Полтавщина, Слобожанщина) в XVI–XVII веках, когда формировался реестр казацкой старшины и мещан. Следовательно, родоначальник Моиссенко мог быть запорожцем или крестьянином, чьего отца звали Моисеем.

Интересная деталь: двойное «с» в написании не случайно. В украинском языке имя Мойсей даёт форму «Мойсеєнко», где одна «с» переходит в суффикс. В русской же традиции, где имя звучит как Моисей, при добавлении суффикса -енко часто удваивали согласную, чтобы сохранить ударение на корне и не допустить оглушения. Встречаются и варианты написания Моисеенко (с одной «с») — это более поздняя упрощённая форма, но Моиссенко — исторически точная, так как она подчёркивает принадлежность к украинской фамильной модели.

Географически фамилия тяготеет к южным и центральным областям России, куда в XVIII–XIX веках активно переселялись украинские крестьяне и казаки: Курская, Воронежская, Ростовская губернии, Кубань. В советское время носители фамилии расселились по всей стране, но её «украинский след» остаётся основным. Социального статуса фамилия не несёт: её носили и казаки, и крестьяне, и мещане. Не стоит искать в ней дворянских корней — это фамилия простого человека, чей предок получил прозвище по имени отца, что типично для массовой народной ономастики.