Фамилия Молчанкин образована от прозвища Молчанка. Оно ведет свое начало от нарицательного «молчан» - так в старину называли молчаливого, неразговорчивого, а также скрытного человека. Соответственно, прозвище Молчанка содержало указание на особенности характера и поведения основателя фамилии. Согласно другой гипотезе, в основе фамилии Молчанкин лежит не прозвище, а мирское имя Молчанка – так могли прозвать спокойного, тихого ребенка. Веселовского упоминаются родственные прозвища и фамилии: Иван Дмитриевич Молчан Чеглоков (первая половина XVI в.), Андрей Борисович Молчан (1535 г., Вологда), а также Иван Федорович Молчан Ошанин (1570 г.). Так и прозвище Молчанка закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Молчанкин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Молчанка, со временем получил фамилию Молчанкин.