Фамилия Молодин образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей — от прозвища или имени с помощью суффикса -ин. Этот суффикс, в отличие от -ов/-ев, указывает на принадлежность первому обладателю: Молодин означает «сын Молодого» или «человек из рода Молодого». Основа здесь — прилагательное «молодой» в его краткой форме «молод», что и дало прозвище Молодой.

Прозвище Молодой в Древней Руси давали не столько по возрасту, сколько по характеру или положению. Чаще всего так называли младшего сына в семье, чтобы отличить его от старших братьев. Иногда прозвище закреплялось за бойким, энергичным человеком, который не по годам рано повзрослел или, наоборот, сохранял юношескую живость в зрелости. В новгородских и псковских землях, где активно бытовали прозвищные фамилии, «Молодой» могло стать и именем-оберегом: считалось, что, называя сына Молодым, родители желали ему долгих лет жизни.

В ономастике фамилию Молодин нередко сравнивают с однокоренными Молодцов, Молодкин, Молодяев. Но есть и любопытный нюанс: в некоторых говорах слово «молодой» имело значение «неженатый», «холостой». Поэтому предок-Молодин мог быть не просто молодым, а именно неженатым мужчиной, что в крестьянской среде было заметной социальной характеристикой. Встречается фамилия и в формах Молодинов (с двойным суффиксом) — это более поздняя, книжная вариация, возникшая при переписях.

Ареал фамилии довольно широк, но заметно тяготеет к центральным и северным областям России: Московской, Ярославской, Вологодской, а также к Поволжью. В дворянских родословных книгах Молодины не значатся — это фамилия крестьянская и мещанская. Среди известных носителей, о которых стоит упомянуть, — советский и российский археолог Вячеслав Иванович Молодин, специалист по древностям Сибири, но его фамилия, скорее всего, того же прозвищного происхождения.

Таким образом, Молодин — это фамилия-характеристика, которая прямо указывает на родоначальника: младшего сына, холостяка или просто человека, которого окружающие запомнили по его молодости или пылкому нраву.