Фамилия Мордвишина — женская форма фамилии Мордвишин, и её происхождение напрямую связано с древним этнонимом. В основе лежит слово «мордвин» — так вплоть до XX века в русском языке называли представителя финно-угорского народа, который сегодня известен как мордва (включает эрзю и мокшу). Модель образования типична для русских фамилий: к прозвищу или именованию Мордвиш (разговорная, «усечённая» форма от «мордвин») добавился патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «сын Мордвиша». Таким образом, Мордвишин буквально означал «потомок человека по прозвищу Мордвиш».

Вероятнее всего, фамилия возникла не на территории современной Мордовии, а в зонах активных контактов русского и мордовского населения. Типичные регионы бытования — бывшие Нижегородская, Пензенская, Симбирская и Тамбовская губернии. Там прозвище Мордвиш могли дать не только этническому мордвину, но и русскому, который долго жил среди мордвы, перенял их обычаи или говорил с заметным акцентом. В XVI–XVII веках, когда шло активное заселение «дикого поля» и Поволжья, такие прозвища были не столько указанием на национальность, сколько бытовой меткой человека.

Стоит обратить внимание на суффикс -ш- в основе. Это не стандартный уменьшительный суффикс (как -к- или -ок-), а скорее разговорное упрощение, свойственное северо-восточным русским говорам. Сравните: Иван → Иваш, Пётр → Петруш, мордвин → Мордвиш. Такая форма звучала фамильярно и могла закрепиться за человеком не самого высокого социального статуса — крестьянином, посадским или служилым человеком «по прибору» (стрельцом, казаком). В дворянских родословных книгах эта фамилия не встречается, что подтверждает её «низовое» происхождение.

Ошибочно связывать фамилию с глаголом «мордовать» (мучить) или словом «морда» — это народная этимология, не выдерживающая критики. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Мордви́шина, хотя в некоторых говорах могло смещаться на третий. Поскольку фамилия редкая, её носители сегодня рассеяны по всей России, но наибольшая концентрация по-прежнему фиксируется в Поволжье и Центральном Черноземье.