Фамилия Москалюкова — женская форма, образованная от мужской фамилии Москалюков. В основе лежит прозвище или мирское имя Москалюк. Разбор этой фамилии интересен тем, что в ней одновременно работают два суффикса: украинский уменьшительный -юк и русский патронимический -ов. Сначала от слова «москаль» образовали типично украинское прозвище Москалюк («маленький москаль» или «сын москаля»), а затем, когда носитель этого прозвища попал в русскую среду, фамилию русифицировали по модели -ов. Получилась фамилия-гибрид, которая указывает на контакт двух культур.

Само слово «москаль» в украинском и белорусском языках исторически обозначало русского человека, солдата или выходца из Московского государства. Прозвище Москаль было распространено на юго-западных землях и не всегда носило пренебрежительный оттенок — часто так называли пришлого человека с севера или того, кто служил в армии. Суффикс -юк в украинской ономастике типичен для Западной Украины, особенно для Волыни и Подолья. Соответственно, географически фамилия Москалюков (и Москалюкова) должна была закрепиться в регионах, где украинская традиция именования пересекалась с русским делопроизводством: на Слобожанщине, в Новороссии или среди переселенцев на Кубань.

Словообразовательная модель здесь двойная, что встречается нечасто. Обычно фамилии на -юк (Москалюк) остаются без изменений, если семья сохраняет украинские корни. Появление дополнительного -ов говорит о том, что предок носителя фамилии либо переехал в великорусские губернии, либо попал в реестры казачьих войск, где фамилии часто «обрусевали» для единообразия. Так что Москалюковы — это, скорее всего, потомки украинского казака или крестьянина, которого в документах записали на русский лад.

Фамилия редкая, в списках столбового дворянства не встречается — это однозначно крестьянская или казачья фамилия, возникшая не ранее XVII века, когда слово «москаль» стало устойчивым бытовым прозвищем. Сегодня она бытует в основном на юге России и на востоке Украины, что подтверждает её пограничное происхождение.