Фамилия Мотузишена — редкий случай, когда географию происхождения можно определить почти наверняка. Суффикс -ена (а не -енко) указывает на западную часть бывшей Российской империи, скорее всего, на территорию современной Беларуси или восточной Литвы. В белорусской ономастике фамилии на -ёнак/-онак и -ена встречаются в Гродненской и Витебской областях. Форма на -ена — это, по сути, вариант суффикса -еня, который обозначал «ребёнка» или «потомка» (как уменьшительная форма). То есть Мотузишена — это буквально «маленький Мотуз» или «сын Мотуза».

Основа фамилии — Мотуз. В белорусском и украинском языках «мотуз» (мотузка) — это верёвка, бечёвка. Прозвище Мотуз могли дать человеку, который занимался изготовлением верёвок, торговал ими или, в переносном смысле, был «верёвочным» — то есть гибким, увёртливым. Встречается также значение «мотуз» как «поводок», что могло указывать на пастуха или охотника, водившего собак на своре.

С точки зрения словообразования, фамилия прошла два этапа. Сначала от прозвища Мотуз образовали патроним (отчество) Мотузиш — с помощью суффикса -иш (в белорусском это аналог русского -ич, означающий «сын такого-то»). Затем к этой основе добавили ещё один, «внутренний» суффикс -ена, превративший отчество в фамилию. Получается «внук Мотуза» или «потомок семьи Мотузишей». Такая двойная суффиксация — признак того, что фамилия закрепилась не сразу, а эволюционировала из уличного прозвища рода.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. В Беларуси и Польше встречаются фамилии Мотуз, Мотузко, Мотузенко. Форма Мотузишена — самая редкая и «длинная», что говорит о её локальном, возможно, даже деревенском происхождении. В метрических книгах XIX века такую фамилию могли записать по-разному: Мотузишен, Мотузишена, Мотузишевна (для женщины). Вариант с окончанием -а (Мотузишена) закрепился, вероятно, как женская форма, ставшая общей для всего рода.

Никаких сведений о дворянском происхождении этой фамилии нет. Скорее всего, это фамилия крестьянская или мещанская, возникшая в среде, где прозвища по ремеслу или внешнему виду были нормой. Если у вас есть семейное предание о предках-канатчиках или веревочниках, оно хорошо вписывается в этимологию.