Каноническое имя Моисей восходит к древнееврейскому слову «мешу», которое имеет значение «дитя, ребенок». Имя Моисей имеет различные формы: Муса (у мусульман), Мозе (у немцев), Мозес (у англичан), Моиз (у французов). От этого имени были также образованы просторечные формы, одна из которых — Мойса — и лег в основу данной фамилии. Менее вероятной представляется этимологическая связь фамилии с украинским глаголом «мосувати», который переводится как «подкреплять, усиливать». Поэтому Moisuzenko буквально понималось как «сын Моисея». Фамилия Мойсузенко образована от имени Мойсуз, являющегося производной формой имени Моисей. Оно в переводе с древнееврейского означает «спасенный из воды». Призванный богом спасти израильские племена из фараоновского рабства, Моисей вывел их из Египта сквозь расступившиеся воды «Чермного» (Красного) моря. Так, наличие в фамилии Мойсузенко суффикса -енко указывает на то, что она сформировалась под славянским влиянием и принадлежит еврейскому роду, основатель которого проживал на территории Украины.