Фамилия Мойсуев — редкая и по-своему неожиданная для русского уха, хотя образована по самой ходовой модели: суффикс -ев присоединён к основе Мойсуй. Такая модель типична для фамилий, возникших от полных или уменьшительных форм крестильных имён, но с одним важным нюансом: имя Мойсуй — это не что иное, как просторечная, народная переделка библейского имени Моисей. В русских говорах, особенно в южнорусских и украинских, звук «с» перед гласной мог озвончаться или, наоборот, упрощаться, а окончание -ей в бытовой речи часто сокращалось до -уй (сравните: Михайло — Михай, Андрей — Андруй). Так Моисей превратился в Мойсуя, а отчество от этой формы — в фамилию Мойсуев.

Есть и другая, менее вероятная версия: что в основе лежит не имя, а прозвище от глагола «мыть» или «мойка». Но она плохо объясняет суффикс -уй, который в русских прозвищах встречается редко и обычно несёт уменьшительно-ласкательный оттенок (как в именах Ванюй, Петруй). Прозвище «Мойсуй» в значении «мой, суй» звучит как искусственное построение, а не живое народное слово. Поэтому версия с именем Моисей — основная.

Географически фамилия Мойсуев почти не выходит за пределы регионов, где было сильно влияние украинского и южновеликорусского произношения. Встречается она в основном на юге России, в бывших областях Войска Донского, на Кубани и в Ставрополье. Там же фиксируется и вариант Мойсюев — с «ю» вместо «у», что ещё ближе к украинской огласовке имени Мойсей.

Интересно, что фамилия сохранила архаичную форму, которая в центральных и северных говорах давно вытеснена церковным «Моисеев» или «Мосеев». Мойсуев — это как раз тот случай, когда народная этимология и живая речь закрепились в паспорте, обойдя книжную норму. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или казаками, а само имя Моисей давали в честь святого, но в быту переиначивали на свой лад. Сословной элиты среди Мойсуевых не было — фамилия осталась простонародной, что и делает её ценным свидетелем языковой истории.