Фамилия Мудрагеля — редкий случай, когда прозвище сохранилось почти без изменений, не превратившись в стандартное Мудрагелов или Мудрагелев. Её основа — южнорусское или украинское слово «мудрагель», которое означало хитрого, изворотливого человека, умеющего выкрутиться из любой ситуации. В говорах это слово имело ироничный оттенок: не столько «мудрец», сколько «пройдоха» или «ловкач». Человек, получивший такое прозвище, вероятно, славился смекалкой или умением обвести других вокруг пальца — в крестьянской среде это качество ценили, но и посмеивались над ним.

Фамилия образована по архаичной беспатронимической модели: суффикс -я (Мудрагел-я) характерен для украинских и белорусских фамилий, где он передаёт принадлежность или прозвищную характеристику без отчества. В русской ономастике такие формы редки и обычно указывают на западное происхождение рода. Скорее всего, предки носителя фамилии жили на территории современной Украины, в южных областях России или в Беларуси — там, где ударение в слове «мудрагель» падало на второй слог, а окончание -я закрепляло прозвище как родовое имя.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Мудров, Мудрецов, Мудрак) показывает, что Мудрагеля — не производная от имени или профессии, а прямая фиксация устного прозвища. В документах XVII–XVIII веков такие фамилии встречались у казаков и однодворцев: прозвище могло закрепиться за целым родом, если его основатель был заметной фигурой в общине. Сословная принадлежность по фамилии не определяется — Мудрагеля могли носить и крестьяне, и мещане, и казаки, в зависимости от региона.

Сегодня фамилия остаётся редкой. Её носители встречаются в основном на юге России и в восточной Украине. Любопытно, что в переписях XIX века иногда фиксировали написание «Мудрагель» без окончания -я — это говорит о том, что форма на -я могла быть местным диалектным вариантом.