Фамилия Муханзаева — яркий пример того, как географическое происхождение предков можно прочитать прямо в окончании. Суффикс -ев (в мужском варианте Муханзаев) указывает на русский способ оформления фамилий, но сама основа — тюркская, скорее всего казахская или ногайская. Такие фамилии обычно возникали на стыке культур: в регионах, где русское население веками соседствовало с тюркскими народами, например, в Астраханской, Оренбургской областях или на Северном Кавказе.

В основе фамилии лежит имя Муханза (Мұханза). Это сложносоставное имя, где первая часть «Мухан» — диалектный или сокращённый вариант имени Мухаммед (Мухаммад), очень распространённого в исламском мире. Вторая часть «за» или «зай» восходит к персидскому слову «задэ» — «рождённый, потомок». Таким образом, имя Муханза буквально означает «рождённый Мухаммедом» или «потомок Мухаммеда». Оно могло даваться в честь пророка или как пожелание ребёнку носить благословенное имя. В быту такое имя нередко сокращалось, и в документах фиксировалось уже в русифицированной форме.

Фамилия Муханзаева образована по типичной русской патронимической модели: к основе (имени отца Муханза) добавили суффикс принадлежности -ев. Получается, что в буквальном переводе на современный язык Муханзаев — это «сын Муханзы». Женская форма Муханзаева — это соответственно «дочь» или «жена» такого человека. Интересно, что в тюркской среде суффикс -ев мог закрепиться не только из-за прямого русского влияния, но и через метрические книги, где священники или писцы записывали носителей фамилии на русский лад.

Встречаемость фамилии невысокая, что говорит о её локальном происхождении. Если искать корни, стоит обратить внимание на регионы традиционного проживания казахов (особенно Западный Казахстан, где много родов с окончаниями на -ев) или на астраханских татар-карагашей. Социально носители фамилии могли быть как кочевниками-скотоводами, так и оседлыми крестьянами, принявшими православие или сохранившими мусульманскую веру, но в любом случае получившими фамилию по отцу при переписях XIX — начала XX века.