Фамилия Мухлисова явно женского рода, а её мужской вариант — Мухлисов. В русской традиции такие фамилии обычно образуются от прозвищ или имён, оканчивающихся на твёрдый согласный, с помощью суффикса -ов. Но здесь основа не славянская, а восточная, что сразу бросается в глаза.

Корень фамилии — арабское имя Мухлис (مُخْلِص). В переводе с арабского оно означает «искренний», «чистосердечный», «преданный». Это одно из имён, которое в исламской культуре давали мальчикам, подчёркивая их честность и верность. В тюркских языках, особенно у татар и башкир, имя Мухлис было распространено, и от него через патронимическую модель (сын Мухлиса) возникла фамилия Мухлисов.

Географически фамилия Мухлисова чаще всего встречается в Поволжье и на Урале — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Это типичный регион, где пересекались русская и тюркская ономастика. Интересно, что в дореволюционных метрических книгах можно встретить написание «Мухлисова» с ударением на второй слог, что ближе к арабскому произношению, хотя в современном русском языке ударение может смещаться.

Сословный состав носителей фамилии неоднороден. Среди Мухлисовых были и крестьяне, и купцы, и даже представители духовенства — муллы, поскольку имя Мухлис нередко давали в семьях, связанных с исламским образованием. Однако специальных исследований по этой фамилии мало, поэтому давать точную статистику по дворянству или казачеству рискованно. Можно лишь сказать, что это довольно редкая фамилия, не попавшая в массовые списки XIX века.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Мухлисов отличается от, скажем, Мухтарова (от имени Мухтар — «избранный») или Мухаметова (от имени Мухаммед) именно семантикой искренности, а не религиозного или административного статуса. Это делает её личностно окрашенной: предок, скорее всего, носил прозвище или имя, подчёркивавшее его честность и прямоту.