Фамилия Муллабаев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Муллабаев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Муллабаев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Муллабаев образована от имени Муллабай, которое состоит из двух частей. Вторая часть фамилии — бай — в переводе означает «хозяин, господин». Таким образом, имя Муллабай можно перевести как «господин мулла». Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Муллабаев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Муллабаев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.