Фамилия Мулладжанов — яркий образец восточного именования, адаптированного русской грамматикой. Её основа восходит к арабско-персидскому составному имени Мулладжан. Первая часть, «мулла» (от арабского мауля — «господин», «владыка»), в исламской традиции означает религиозного наставника, учёного или просто грамотного человека, знающего Коран. Вторая часть, «джан» (персидское جان — «душа», «жизнь»), в тюркских и иранских языках — ласковое обращение, почти как «дорогой», «любимый». Вместе Мулладжан можно перевести как «душа муллы» или «дорогой, как мулла», но скорее это было личное имя-пожелание, подчёркивающее уважение к духовному сану.

Русский суффикс -ов превратил восточное имя в фамилию по стандартной для Российской империи модели: «чей?» — Мулладжанов, то есть сын или потомок Мулладжана. Такое оформление характерно для тюркских и кавказских народов, которые входили в состав государства и получали фамилии по русскому образцу в XIX–XX веках. Носители фамилии чаще всего встречаются среди узбеков, таджиков, азербайджанцев и народов Дагестана, где имя Мулладжан было употребительным.

Интересно, что фамилия сохранила двойной корень, редкий для славянских фамилий, но обычный для восточных. Встречаются варианты написания с одной «л» (Муладжанов) или через «а» на конце (Мулладжанов), но исходная форма с удвоенной «л» и суффиксом -ов — самая частотная. Социальный статус предка, скорее всего, был связан с духовенством или хотя бы с грамотностью: муллами называли не только профессиональных священнослужителей, но и учителей, писцов. Впрочем, со временем фамилия потеряла прямую связь с религией и стала просто родовым именем.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями вроде Муллаев или Муллаханов, то Мулладжанов выделяется именно «ласкательным» компонентом «джан». Это говорит о том, что имя-основа было не официальным титулом, а скорее домашним, тёплым прозвищем — возможно, так называли ребёнка в семье уважаемого муллы. Других версий происхождения, кроме как от личного имени, у этой фамилии нет: попытки связать её с географическими названиями или профессиями выглядят натяжкой.