Фамилия Муллашев образована от имени Муллаш — так в тюркской среде называли человека, чьё полное имя звучало как Мулладжан. Вторая часть этого составного имени, «джан», в переводе с персидского означает «душа», «жизнь». Поэтому имя Муллаш можно осмыслить как «душа наставника»: первая часть восходит к арабскому слову «мулла» — учёный, учитель, духовный наставник.

Модель образования фамилии проста и прозрачна: к диалектной краткой форме имени Муллаш добавили типичный русский патронимический суффикс -ев, который указывает на происхождение по отцу. Получается, что Муллашев — это буквально «сын Муллаша». Такая схема характерна для фамилий, которые складывались у тюркских народов в XIX — начале XX века, когда родовые имена начали оформлять по русскому образцу, часто через священников или писарей, фиксировавших имя главы семьи.

Интересно, что в самой фамилии сохранился не полный вариант Мулладжан, а именно сокращённая форма Муллаш. Это говорит о живом, разговорном употреблении имени в быту — так человека могли звать в семье или в деревне, а уже из этого обиходного имени выросла фамилия. Подобное усечение составных имён с компонентом «джан» встречается и в других фамилиях, например Балташев или Худайшев, где вторая часть имени также отпадала при образовании патронима.

Сам корень «мулла» в фамилии указывает на религиозную или образованную среду предков. Муллой в исламской традиции называют знатока Корана, учителя при мечети. Однако не стоит думать, что каждый Муллашев — потомок именно духовного лица. Часто прозвище Мулла давали грамотному человеку, начитанному, умеющему писать, даже если он не служил в мечети. А имя Мулладжан, от которого всё пошло, могли носить и дети в семьях, где отца уважительно звали муллой.

Фамилия Муллашев встречается преимущественно у татар и башкир, а также у некоторых других тюркских народов Поволжья и Урала. География бытования — Казань, Уфа, Оренбуржье, Челябинская область. В документах XIX века фамилию могли записывать по-разному: Муллашев, Мулашев, реже Муллажаннов — в зависимости от того, какую форму имени выбрал писец. Со временем написание устоялось как Муллашев, и именно оно закрепилось в современных документах.